MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 42066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018630	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018630	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018630	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018630	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018630	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018630	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018630	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018630	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475458
10	NC_018630	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475458
11	NC_018630	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
12	NC_018630	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475458
13	NC_018630	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475458
14	NC_018630	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	410475458
15	NC_018630	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475458
16	NC_018630	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
17	NC_018630	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	410475458
18	NC_018630	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	410475458
19	NC_018630	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	410475458
20	NC_018630	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
21	NC_018630	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475458
22	NC_018630	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	410475458
23	NC_018630	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475458
24	NC_018630	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475458
25	NC_018630	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	410475458
26	NC_018630	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475458
27	NC_018630	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475458
28	NC_018630	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	410475458
29	NC_018630	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	410475458
30	NC_018630	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	410475458
31	NC_018630	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	410475458
32	NC_018630	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	410475458
33	NC_018630	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475458
34	NC_018630	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018630	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018630	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018630	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018630	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018630	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018630	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018630	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475459
42	NC_018630	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	410475459
43	NC_018630	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475459
44	NC_018630	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	410475459
45	NC_018630	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	410475459
46	NC_018630	TTG	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475459
47	NC_018630	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
48	NC_018630	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
49	NC_018630	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
50	NC_018630	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
51	NC_018630	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	410475459
52	NC_018630	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475459
53	NC_018630	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475459
54	NC_018630	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	410475459
55	NC_018630	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	410475459
56	NC_018630	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	410475459
57	NC_018630	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
58	NC_018630	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
59	NC_018630	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475459
60	NC_018630	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475459
61	NC_018630	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	410475459
62	NC_018630	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475459
63	NC_018630	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	410475459
64	NC_018630	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	410475459
65	NC_018630	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475459
66	NC_018630	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475460
67	NC_018630	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475460
68	NC_018630	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	410475460
69	NC_018630	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	410475460
70	NC_018630	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475460
71	NC_018630	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475460
72	NC_018630	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475460
73	NC_018630	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018630	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018630	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
76	NC_018630	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
77	NC_018630	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
78	NC_018630	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475461
79	NC_018630	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	410475461
80	NC_018630	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
81	NC_018630	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475461
82	NC_018630	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
83	NC_018630	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
84	NC_018630	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	410475461
85	NC_018630	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
86	NC_018630	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
87	NC_018630	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
88	NC_018630	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	410475461
89	NC_018630	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	410475461
90	NC_018630	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	410475461
91	NC_018630	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
92	NC_018630	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475461
93	NC_018630	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
94	NC_018630	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475461
95	NC_018630	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
96	NC_018630	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
97	NC_018630	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	410475461
98	NC_018630	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018630	A	7	7	4341	4347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018630	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	410475462
101	NC_018630	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	410475462
102	NC_018630	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	410475462
103	NC_018630	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475462
104	NC_018630	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	410475462
105	NC_018630	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	410475462
106	NC_018630	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	410475462
107	NC_018630	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475462
108	NC_018630	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
109	NC_018630	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475462
110	NC_018630	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475462
111	NC_018630	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
112	NC_018630	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475462
113	NC_018630	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475462
114	NC_018630	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
115	NC_018630	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475462
116	NC_018630	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
117	NC_018630	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
118	NC_018630	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
119	NC_018630	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475463
120	NC_018630	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
121	NC_018630	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
122	NC_018630	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475463
123	NC_018630	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
124	NC_018630	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	410475463
125	NC_018630	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475463
126	NC_018630	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	410475463
127	NC_018630	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
128	NC_018630	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475463
129	NC_018630	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	410475463
130	NC_018630	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
131	NC_018630	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	410475463
132	NC_018630	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	410475463
133	NC_018630	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
134	NC_018630	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
135	NC_018630	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
136	NC_018630	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
137	NC_018630	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
138	NC_018630	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
139	NC_018630	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	410475463
140	NC_018630	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	410475463
141	NC_018630	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
142	NC_018630	A	7	7	6131	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
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155	NC_018630	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
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161	NC_018630	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
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172	NC_018630	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
173	NC_018630	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	410475463
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180	NC_018630	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
181	NC_018630	AAGA	2	8	8372	8379	75 %	0 %	25 %	0 %	410475463
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251	NC_018630	CTTA	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	410475468
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256	NC_018630	CAA	2	6	11542	11547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475468
257	NC_018630	A	7	7	11625	11631	100 %	0 %	0 %	0 %	410475468
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259	NC_018630	TTA	2	6	11687	11692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475468
260	NC_018630	AAT	2	6	11737	11742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475468
261	NC_018630	A	7	7	11749	11755	100 %	0 %	0 %	0 %	410475468
262	NC_018630	TA	3	6	11785	11790	50 %	50 %	0 %	0 %	410475468
263	NC_018630	A	6	6	11792	11797	100 %	0 %	0 %	0 %	410475468
264	NC_018630	A	6	6	11807	11812	100 %	0 %	0 %	0 %	410475468
265	NC_018630	A	6	6	11830	11835	100 %	0 %	0 %	0 %	410475469
266	NC_018630	AGC	2	6	11865	11870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475469
267	NC_018630	A	6	6	11872	11877	100 %	0 %	0 %	0 %	410475469
268	NC_018630	A	6	6	11910	11915	100 %	0 %	0 %	0 %	410475469
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270	NC_018630	TGG	2	6	12024	12029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475469
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405	NC_018630	GGA	2	6	17580	17585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
406	NC_018630	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
407	NC_018630	ACA	2	6	17698	17703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_018630	ATG	2	6	17765	17770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_018630	GGA	2	6	17898	17903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_018630	ACC	2	6	18164	18169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_018630	AAT	2	6	18184	18189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_018630	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
415	NC_018630	TG	3	6	18373	18378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_018630	TAG	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_018630	GA	3	6	18820	18825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_018630	CT	3	6	18936	18941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
424	NC_018630	GAT	2	6	18954	18959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
425	NC_018630	CGG	2	6	19045	19050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_018630	GA	3	6	19143	19148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
427	NC_018630	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_018630	CCT	2	6	19403	19408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NC_018630	CGT	2	6	19734	19739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_018630	TA	3	6	19938	19943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018630	GA	3	6	19958	19963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_018630	AGT	2	6	20192	20197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_018630	GTA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
441	NC_018630	ATG	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_018630	T	6	6	20341	20346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_018630	TAA	3	9	20353	20361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_018630	GTA	2	6	20477	20482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475472
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452	NC_018630	GAA	2	6	20907	20912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_018630	T	6	6	20999	21004	0 %	100 %	0 %	0 %	410475473
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